Ponedjeljak, 24. lipnja 2013. - Znanstvenici iz Australije i Sjedinjenih Država pružaju nova saznanja za razumijevanje trodimenzionalne strukture genoma, jedan od najvećih izazova s kojim se trenutno suočava područje genomike i genetike, čije zaključke objavljuje u svom digitalnom izdanju. ' Priroda genetika '.
Otprilike tri metra DNK usko su presavijeni u jezgri svake stanice našeg tijela, što omogućava nekim genima da se "izraze" ili aktiviraju, isključujući druge. Liječnici Tim Mercer i John Mattick s Instituta za medicinska istraživanja Garvan u Sydneyu i profesor John Stamatoyannopoulos sa Sveučilišta u Washingtonu u Seattlu analizirali su 3D strukturu genoma s velikom razlučivošću.
Geni su sastavljeni od "egzona" i "introna", prvi je niz koji kodira i eksprimira proteine, a posljednji proteže se nekodirajuća DNK u mediju. Kako se geni kopiraju ili prepisuju, iz DNK u RNA, nizovi atrona su izrezani ili "spojeni", a preostali egzoni su vezani zajedno kako bi tvorili slijed koji kodira protein. Ovisno o egzonima koji su skenirani, isti gen može stvoriti različite proteine.
Korištenjem velike količine podataka iz projekta ENCODE, dr. Tim Mercer i njegovi kolege zaključili su da se genom savija, zaključujući da su čak i unutar gena odabrani egzoni lako izloženi. "Zamislite dugu i neizmjerno kompliciranu lozu, njezine iskrivljene grane koje predstavljaju neko grožđe koje se može lako otrgnuti, a drugo skrivati izvan njihovog dosega", on je primjer. Mercer.
"U isto vrijeme, zamislite lijeni berač voća koji samo bere grožđe nadohvat ruke", dodaje on. "Isti princip vrijedi i za genom. Specifični geni, pa čak i specifični egzoni, nadohvat su odlaganja." U tom smislu, ovaj istraživač ističe da su posljednjih godina znanstvenici počeli shvaćati kako savijanje genoma pomaže u određivanju njegovog izražavanja i regulacije.
"Ova studija daje prve pokazatelje da trodimenzionalna struktura genoma može utjecati na spajanje gena. Možemo zaključiti da se genom savija na takav način da se promotorsko područje, slijed koji inicira transkripciju gena, pronađeni pored egzona i svi su odvedeni u strojeve za prepisivanje ", naglašava.
"To podržava novi način gledanja na stvari, da se genom savija oko strojeva za transkripciju, a ne obrnuto. Oni geni koji dolaze u kontakt s transkripcijskim strojevima dobivaju kopije, dok dijelovi koji orbitiraju daleko oni se ignoriraju ", zaključuje ovaj istraživač.
Izvor:
Oznake:
Psihologija Dijeta-I-Prehrana Zdravlje
Otprilike tri metra DNK usko su presavijeni u jezgri svake stanice našeg tijela, što omogućava nekim genima da se "izraze" ili aktiviraju, isključujući druge. Liječnici Tim Mercer i John Mattick s Instituta za medicinska istraživanja Garvan u Sydneyu i profesor John Stamatoyannopoulos sa Sveučilišta u Washingtonu u Seattlu analizirali su 3D strukturu genoma s velikom razlučivošću.
Geni su sastavljeni od "egzona" i "introna", prvi je niz koji kodira i eksprimira proteine, a posljednji proteže se nekodirajuća DNK u mediju. Kako se geni kopiraju ili prepisuju, iz DNK u RNA, nizovi atrona su izrezani ili "spojeni", a preostali egzoni su vezani zajedno kako bi tvorili slijed koji kodira protein. Ovisno o egzonima koji su skenirani, isti gen može stvoriti različite proteine.
Korištenjem velike količine podataka iz projekta ENCODE, dr. Tim Mercer i njegovi kolege zaključili su da se genom savija, zaključujući da su čak i unutar gena odabrani egzoni lako izloženi. "Zamislite dugu i neizmjerno kompliciranu lozu, njezine iskrivljene grane koje predstavljaju neko grožđe koje se može lako otrgnuti, a drugo skrivati izvan njihovog dosega", on je primjer. Mercer.
"U isto vrijeme, zamislite lijeni berač voća koji samo bere grožđe nadohvat ruke", dodaje on. "Isti princip vrijedi i za genom. Specifični geni, pa čak i specifični egzoni, nadohvat su odlaganja." U tom smislu, ovaj istraživač ističe da su posljednjih godina znanstvenici počeli shvaćati kako savijanje genoma pomaže u određivanju njegovog izražavanja i regulacije.
"Ova studija daje prve pokazatelje da trodimenzionalna struktura genoma može utjecati na spajanje gena. Možemo zaključiti da se genom savija na takav način da se promotorsko područje, slijed koji inicira transkripciju gena, pronađeni pored egzona i svi su odvedeni u strojeve za prepisivanje ", naglašava.
"To podržava novi način gledanja na stvari, da se genom savija oko strojeva za transkripciju, a ne obrnuto. Oni geni koji dolaze u kontakt s transkripcijskim strojevima dobivaju kopije, dok dijelovi koji orbitiraju daleko oni se ignoriraju ", zaključuje ovaj istraživač.
Izvor:
